22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0822 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0822  hypothetical protein  100 
 
 
565 aa  1176    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.72 
 
 
563 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  31.61 
 
 
412 aa  66.6  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  31.72 
 
 
255 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  30.15 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  29.41 
 
 
417 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  30.46 
 
 
322 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  29.19 
 
 
361 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  23.53 
 
 
405 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
340 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  34.19 
 
 
282 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  29.8 
 
 
322 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.81 
 
 
334 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  30.25 
 
 
372 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.13 
 
 
286 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  23.97 
 
 
253 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.32 
 
 
370 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  29.85 
 
 
700 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1822  hypothetical protein  26.61 
 
 
363 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  29.46 
 
 
343 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  27.61 
 
 
276 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  31.19 
 
 
335 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>