More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3625 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  100 
 
 
283 aa  589  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  42.45 
 
 
280 aa  251  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  29.71 
 
 
317 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1546  esterase/lipase  29.05 
 
 
314 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0472354  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.89 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  27.72 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  28.85 
 
 
311 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  34.15 
 
 
269 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.01 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  32.88 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.49 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.76 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.59 
 
 
321 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  30 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.8 
 
 
344 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.16 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.76 
 
 
322 aa  89  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  23.55 
 
 
411 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.42 
 
 
336 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  28.03 
 
 
471 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  27.73 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  28.84 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.24 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  26.61 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  29.33 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.76 
 
 
420 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.43 
 
 
645 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  25.57 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.57 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  30 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  25.56 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.57 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  27.44 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.37 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.71 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.46 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  26.69 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.23 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  28.21 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  25.57 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.72 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  27.16 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  27.16 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  27.16 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.1 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  24.36 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  26.64 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  27.51 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.32 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  25.94 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.69 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  24.58 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  21.83 
 
 
380 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  25.84 
 
 
644 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  26.69 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  24.58 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  24.58 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  22.58 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  24.58 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  31.14 
 
 
645 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  26.96 
 
 
339 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  24.58 
 
 
412 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.25 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  22.1 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  24.58 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  25.87 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.38 
 
 
311 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  30.99 
 
 
328 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  26.12 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  22.32 
 
 
334 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03310  esterase/lipase  23.77 
 
 
355 aa  62.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  25.21 
 
 
420 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.32 
 
 
308 aa  62.4  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.16 
 
 
406 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25 
 
 
360 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  26.15 
 
 
431 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.25 
 
 
645 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.23 
 
 
338 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  28.2 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.57 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25096  predicted protein  26.05 
 
 
424 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  29.65 
 
 
269 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  26.7 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  25 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.63 
 
 
645 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.63 
 
 
645 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  25.1 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  25.74 
 
 
376 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
310 aa  58.9  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.65 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.65 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  27.47 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  26.01 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.4 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.11 
 
 
645 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3874  hypothetical protein  24.77 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.65 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  27.65 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  27.65 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>