More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4730 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.66 
 
 
300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.34 
 
 
301 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.34 
 
 
301 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.46 
 
 
301 aa  258  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.54 
 
 
333 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  46.05 
 
 
314 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  41.84 
 
 
306 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.77 
 
 
300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.03 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  41.55 
 
 
302 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  46.75 
 
 
412 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.75 
 
 
360 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  46.75 
 
 
315 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  46.75 
 
 
315 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  46.75 
 
 
292 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  46.34 
 
 
315 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  46.34 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  44.61 
 
 
297 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.42 
 
 
319 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.4 
 
 
290 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.5 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  46.22 
 
 
406 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  43.16 
 
 
309 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.01 
 
 
294 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.62 
 
 
278 aa  175  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.35 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  42.44 
 
 
322 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  32.89 
 
 
316 aa  159  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.4 
 
 
308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  39.92 
 
 
274 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.11 
 
 
316 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  33.82 
 
 
286 aa  143  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.19 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.75 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.91 
 
 
1094 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.57 
 
 
275 aa  106  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.73 
 
 
336 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.86 
 
 
277 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  32.14 
 
 
403 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  36.28 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  30.96 
 
 
283 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.82 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  32.93 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.34 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.09 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  29.31 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.24 
 
 
322 aa  95.5  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  38.78 
 
 
310 aa  95.5  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  38.93 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.13 
 
 
343 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.18 
 
 
321 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  32.2 
 
 
305 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  30.84 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  37.4 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.64 
 
 
324 aa  92.4  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.2 
 
 
301 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  30.93 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.47 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  28.36 
 
 
644 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  31.25 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  37.37 
 
 
314 aa  89.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  42.61 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.79 
 
 
407 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.79 
 
 
407 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.79 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  32.52 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  41.5 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.65 
 
 
349 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  34.36 
 
 
288 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.59 
 
 
645 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.75 
 
 
324 aa  86.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.81 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  33.33 
 
 
411 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  28.14 
 
 
300 aa  85.5  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.77 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  38.1 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.14 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.2 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  29.48 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.83 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  28.57 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  36.75 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  28.51 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  29.68 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.53 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  34.03 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.27 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  31.09 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  26.61 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  30.08 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  34.78 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  30.36 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1833  esterase-like protein  27.09 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  28.33 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  26.78 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  36.15 
 
 
593 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  28.33 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.44 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  37.41 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>