More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1930 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  99.67 
 
 		 301 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  93.36 
 
 		 301 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  70.47 
 
 		 300 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.34 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  51.8 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.63 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  50.79 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  45.17 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.34 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  40.91 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  44.48 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  42.32 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  42.32 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.78 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  42.32 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  42.37 
 
 		 412 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  42.03 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  41.69 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.74 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.48 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.01 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  42.14 
 
 		 406 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.54 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  41.2 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.09 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.17 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  33.78 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  33.93 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  38.11 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.33 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.3 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.67 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.81 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.15 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  32.95 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.51 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.6 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2198  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.41 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  35.36 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.74 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  32.76 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  40.56 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  34.45 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  31.44 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  43.84 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.18 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.18 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.18 
 
 		 407 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.28 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  29.36 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  33.78 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0293  esterase/lipase  36.32 
 
 		 381 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  42.28 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.18 
 
 		 407 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  42.19 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  29.68 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  31.39 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.29 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  39.86 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  30.86 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.87 
 
 		 420 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3154  esterase/lipase/thioesterase  30.3 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  31.3 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.11 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  28.51 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  38.06 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  38.03 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  29.73 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  29.2 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  35.83 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.8 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.32 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25096  predicted protein  28.69 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  32.13 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  28.63 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.42 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  29.13 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.28 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.62 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  40.32 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1411  Esterase/lipase  33.04 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.667449 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.3 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.2 
 
 		 645 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  30.81 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  26.19 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  30.81 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  28.63 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.51 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.06 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  30.81 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  26.98 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  33.8 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  31.58 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  26.98 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  28.17 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  26.59 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  30.95 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>