More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2850 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  100 
 
 
308 aa  629  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.85 
 
 
312 aa  139  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.49 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.75 
 
 
321 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  31.68 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32 
 
 
323 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.36 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  32.74 
 
 
411 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  34.05 
 
 
325 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.34 
 
 
322 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  32.81 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  30.67 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  28.42 
 
 
288 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.54 
 
 
344 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.78 
 
 
349 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.41 
 
 
336 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  31.58 
 
 
644 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  30.89 
 
 
471 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  31.3 
 
 
328 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.2 
 
 
324 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.58 
 
 
321 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.18 
 
 
321 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.86 
 
 
407 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.86 
 
 
407 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.81 
 
 
311 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  30.71 
 
 
326 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.86 
 
 
407 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  33.33 
 
 
403 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  27.87 
 
 
318 aa  99  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.08 
 
 
279 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.19 
 
 
420 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  28.66 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  32.88 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.93 
 
 
288 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  29.37 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.93 
 
 
360 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  31.89 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  29.51 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  28.15 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.03 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  30.57 
 
 
317 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.54 
 
 
343 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  31 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.74 
 
 
407 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  31.92 
 
 
414 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  31.92 
 
 
414 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  31.92 
 
 
414 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  27.3 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  34.1 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  34.1 
 
 
315 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  33.03 
 
 
420 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  33.8 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  33.97 
 
 
412 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  33.8 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  33.8 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  28.51 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.37 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.6 
 
 
645 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  28.51 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  31.9 
 
 
340 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.45 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  28.51 
 
 
334 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.45 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  33.33 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  28.46 
 
 
391 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  29.18 
 
 
593 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  31.78 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  28.18 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  30.08 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.41 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  30.1 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.04 
 
 
409 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  31.9 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0293  esterase/lipase  33.8 
 
 
381 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  30.19 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  27.84 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.62 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.14 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.06 
 
 
1094 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.05 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.8 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  28.51 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.61 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.51 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.98 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  27.96 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.1 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  32.37 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.56 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12506  carboxylesterase lipQ  32.79 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329664  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  32.91 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.75 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  27.81 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  43.16 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  30.58 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0739  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.52 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.231286  hitchhiker  0.00721171 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  28.09 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  30.49 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  43.69 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.31 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>