More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1482 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
318 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  69.5 
 
 
316 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.62 
 
 
301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  53.94 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  48.37 
 
 
310 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  39.48 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  36.43 
 
 
315 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  35.14 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  35.09 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.51 
 
 
300 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.37 
 
 
313 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  33.73 
 
 
309 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  46.15 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.73 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.76 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.02 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  30.21 
 
 
274 aa  85.9  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.29 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.04 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.69 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.3 
 
 
322 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.28 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.19 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.53 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  30.61 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.11 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.62 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  28 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  40.65 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  40.65 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  40.65 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  40.65 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  34.1 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  40.65 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  40.65 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  34.07 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.91 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.33 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  30.72 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.33 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6232  esterase/lipase/thioesterase  39.81 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.33 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.67 
 
 
407 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  33.51 
 
 
593 aa  76.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.03 
 
 
420 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.37 
 
 
1094 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.65 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.56 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.06 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.06 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.06 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  41 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  29.61 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  34.8 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.45 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.51 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  30.9 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  41.82 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  41.28 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  30.49 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.22 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  33.12 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  28.12 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  33.12 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  33.12 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2058  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.26 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.06 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  32.62 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.62 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.86 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.19 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.08 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  31.85 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  36.13 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  39.66 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  32.09 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.23 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.02 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  41.3 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  33.83 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  37.6 
 
 
500 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1170  carboxylesterase, type B  36.64 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244419  normal  0.980563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  31.39 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.77 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.56 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.2 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.53 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.01 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  29.9 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  33.06 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.59 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.22 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  28.64 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2303  esterase/lipase-like protein  32.14 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.3 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  35.48 
 
 
406 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.39 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.62 
 
 
376 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>