More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5201 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  50.33 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.17 
 
 		 301 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.37 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  47.37 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  39 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  36.63 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  35.48 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  36.96 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.82 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  42.57 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.03 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  33.75 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.06 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  44.88 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.78 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.75 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.76 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.74 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.68 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.86 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.36 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  31.4 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  35.62 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  30.1 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  36.09 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  35.82 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.84 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.59 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.28 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3921  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.15 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.28 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.5 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  34.51 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  35.67 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.61 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  32.64 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  37.82 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  35.26 
 
 		 593 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.81 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  35.36 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  34.51 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.33 
 
 		 645 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  36.72 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.35 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.1 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  39.22 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  40.16 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.38 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.55 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.52 
 
 		 1094 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  35.71 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00390  conserved hypothetical protein  34.25 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.14 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  39.16 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.14 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  37.9 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.35 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  33.77 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.84 
 
 		 420 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  34.55 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  34.55 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.82 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  40.32 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  34.55 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2107  hypothetical protein  32.6 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  34.55 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  34.55 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  29.76 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.73 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.58 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.05 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.57 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.34 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.03 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.16 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  33.71 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.51 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  35.56 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0114  lipase/esterase, putative  39.66 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  40.32 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.66 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  36.45 
 
 		 644 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.89 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  30.08 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  38.28 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.58 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  39.06 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  33.1 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  33.53 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.56 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  38.46 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  36.55 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2890  putative lipase/carboxylesterase protein  39.13 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.88 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  35.59 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.94 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2058  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.69 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>