165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6510 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  100 
 
 
274 aa  553  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  50.38 
 
 
261 aa  251  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  49.44 
 
 
271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  50.56 
 
 
257 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  52.45 
 
 
284 aa  224  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  52.45 
 
 
284 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  49.82 
 
 
277 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  47.21 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  36.84 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  35.81 
 
 
274 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  36.61 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  36.51 
 
 
288 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  36.67 
 
 
303 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  29.24 
 
 
271 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  32.93 
 
 
283 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  32.63 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  31.73 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  34.48 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  32.23 
 
 
275 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  33.47 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  34.94 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  33.06 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  32.49 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  32.49 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  32.32 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  32.49 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  32.34 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  32.49 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  32.49 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  32.49 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  34.05 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  31.47 
 
 
285 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  31.85 
 
 
304 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  32.34 
 
 
305 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  31.75 
 
 
272 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  34.71 
 
 
301 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  31.48 
 
 
275 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  34.48 
 
 
275 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  32.18 
 
 
276 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.54 
 
 
294 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  31.48 
 
 
268 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  31.85 
 
 
275 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  31.85 
 
 
275 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  33.33 
 
 
288 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  32.91 
 
 
281 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  34.94 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  33.33 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  34.18 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  29.82 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  32.33 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  29.68 
 
 
296 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  26.26 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  26.62 
 
 
308 aa  92.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  28.39 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  29.67 
 
 
324 aa  86.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  26.91 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  28.57 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  31.4 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  29.94 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  30.08 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.52 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  36.55 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  31.37 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.48 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.48 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.2 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.69 
 
 
333 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.12 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  34.35 
 
 
297 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.52 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  29.73 
 
 
315 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.36 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  29.94 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  29.19 
 
 
412 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  29.19 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  27.31 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.54 
 
 
318 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  28.72 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  28.72 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  34.78 
 
 
593 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  38.24 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  34.51 
 
 
316 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  36.52 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.33 
 
 
311 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.93 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  28.86 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.04 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  31.68 
 
 
406 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.9 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  31.61 
 
 
316 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  35.25 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  31.2 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.27 
 
 
336 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.36 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.25 
 
 
292 aa  55.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  31.67 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.32 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  29.46 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  31.48 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.82 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>