More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0276 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
308 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  46.04 
 
 
297 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.41 
 
 
290 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.43 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.62 
 
 
300 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.43 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.05 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.91 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.8 
 
 
302 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  40.17 
 
 
306 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.4 
 
 
288 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.69 
 
 
360 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  34.33 
 
 
314 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  37.38 
 
 
292 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  37.38 
 
 
315 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  37.38 
 
 
315 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  37.38 
 
 
412 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  37.38 
 
 
315 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  37.38 
 
 
315 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  37.23 
 
 
309 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.98 
 
 
333 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  32.45 
 
 
316 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  36.29 
 
 
406 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.17 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.55 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.91 
 
 
319 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.84 
 
 
336 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.08 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  34.07 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  34.76 
 
 
297 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.96 
 
 
311 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.78 
 
 
322 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.05 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  29.69 
 
 
274 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  41.88 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.76 
 
 
275 aa  92.8  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  40.35 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  32 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3173  acetyl esterase, putative  26.35 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.64 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.44 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  25.22 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3188  acetyl esterase, putative  25.7 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.29 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.46 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  33.8 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  26.19 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  26.78 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.55 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  27.23 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  26.36 
 
 
403 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  23.72 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  28.16 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  29.05 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  26.05 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.64 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  29.52 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.92 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  30.37 
 
 
420 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  29.61 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3154  esterase/lipase/thioesterase  27 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246115  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  29.07 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.58 
 
 
407 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.58 
 
 
407 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.56 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  31.16 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  34.65 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.58 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  26.83 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  28.69 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  31.33 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  25.28 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  28.68 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45964  predicted protein  25.1 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.08 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  35.88 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.29 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  32 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25096  predicted protein  24.89 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3093  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.27 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.1 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3439  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.57 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  29.86 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2198  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.1 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  26.11 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  27.78 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  32.31 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  27.78 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  29.6 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.64 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1411  Esterase/lipase  34.19 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.667449 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  27.78 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  34.11 
 
 
529 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  29.33 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  36.44 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  25.95 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  34.75 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.58 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  27.41 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.31 
 
 
422 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>