More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2004 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  100 
 
 		 291 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  35.66 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  39.34 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.74 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  33.57 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  39.26 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  36.62 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  35.51 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  35.82 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  36.23 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  35.98 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  38.6 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  30.46 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  35.83 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  32.97 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  32.83 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  34.29 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  33.09 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  33.57 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  33.91 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  34.09 
 
 		 291 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  33.08 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  32.62 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  29.63 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  32.7 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  29.55 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  32.14 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  31.02 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  38.36 
 
 		 208 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  32.03 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  32.38 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  32.38 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  30.98 
 
 		 271 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  29.54 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  30.66 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  31.32 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  25.78 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  31.34 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  28.32 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  31.05 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  28.32 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  28.32 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  28.32 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  28.32 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  28.32 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  31.43 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  30.26 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  34.62 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  33.73 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  32.89 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.52 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  29.82 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.84 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.33 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  29.55 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  27.84 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  28.46 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  25.27 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  27.59 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.87 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  29.01 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  29.01 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.95 
 
 		 349 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  28.63 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.48 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  28.63 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  28.63 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  28.63 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.22 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.46 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.26 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  29.43 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.11 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  31.61 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.04 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.55 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.81 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.44 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  28.97 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  29.81 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.65 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  28.5 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.78 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.53 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  34.92 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.39 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  27.68 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.08 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.44 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  28.09 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  32 
 
 		 644 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.82 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  30.99 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  39.6 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  29.24 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  27.56 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  34.45 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.63 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>