139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2888 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  53.21 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  53.67 
 
 		 277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  53.88 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  53.49 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  50.56 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  47.37 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  42.69 
 
 		 271 aa  178  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  38.85 
 
 		 274 aa  154  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  38.72 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  37.88 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  37.93 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  37.64 
 
 		 304 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  37.45 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  38.2 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  38.2 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  37.45 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  38.04 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  36.6 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  38.29 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  34.21 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  35.04 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  37.36 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  37.4 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  36.47 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  35.46 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  35.82 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  31.54 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  35 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  33.21 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  33.21 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  33.21 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  33.21 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  33.21 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  33.21 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  35.38 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  35.21 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  35.85 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  29.66 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  33.21 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  32.81 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  31.75 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  32.95 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  35.47 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  31.11 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.19 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  27.55 
 
 		 271 aa  98.6  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  31.25 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  31 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  28.11 
 
 		 324 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  30.34 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  32.27 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  36.27 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  24.57 
 
 		 308 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  35.96 
 
 		 284 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  35.5 
 
 		 280 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  32.47 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  29.17 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.88 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  30.92 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  37.3 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  37.3 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  37.3 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  37.3 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  37.3 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  37.3 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  32.77 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  33.06 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.2 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  33.12 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.82 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.19 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.19 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  37.5 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  31.55 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  31.47 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.57 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.17 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.67 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.7 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  31 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  27.2 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  26.61 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  29.17 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.99 
 
 		 288 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.04 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  32.74 
 
 		 593 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  35.59 
 
 		 334 aa  52.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.94 
 
 		 308 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  36.07 
 
 		 322 aa  52.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  38.81 
 
 		 406 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.66 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  31.85 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  27.37 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.91 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  30.23 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  34.45 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  29.76 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  36.13 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>