More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3444 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3444  LipQ  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  47.08 
 
 
309 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2303  esterase/lipase-like protein  50 
 
 
336 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  39.69 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  39.25 
 
 
314 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  34.25 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.38 
 
 
311 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.21 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.29 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  34.95 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.89 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  31.61 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  27.82 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  30.57 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  29.03 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  36 
 
 
302 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  32.62 
 
 
286 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.69 
 
 
349 aa  79  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.13 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.43 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  30.5 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.82 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.82 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.11 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  37.76 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.07 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  27.69 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.65 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.78 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  28.81 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.89 
 
 
420 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.11 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  38.46 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  36.67 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.43 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  36.67 
 
 
334 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  36.67 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 
593 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  28.82 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  34.13 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.72 
 
 
1094 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  30.67 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.75 
 
 
294 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  30.93 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  27.75 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.21 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  34.31 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1292  esterase/lipase  25.62 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.69 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  34.53 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.78 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  28.79 
 
 
326 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  32.89 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.5 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  34.23 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  26.13 
 
 
644 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.82 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.28 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  30.32 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  31.73 
 
 
420 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  29.79 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.02 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  25.89 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.03 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  30.3 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3171  Esterase/lipase-like protein  31.11 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  29.14 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.64 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.89 
 
 
407 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  30.73 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  37.7 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  32.5 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.01 
 
 
406 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  30.95 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  33.59 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.14 
 
 
380 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0293  esterase/lipase  31.82 
 
 
381 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  32.24 
 
 
347 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  29.49 
 
 
315 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.62 
 
 
343 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  30.6 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  33.9 
 
 
325 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  24.7 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  36.36 
 
 
323 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  29.03 
 
 
296 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.62 
 
 
407 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  31.12 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.62 
 
 
407 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.89 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1582  esterase/lipase-like protein  28.7 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.62 
 
 
407 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.25 
 
 
360 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  30.95 
 
 
292 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  31.75 
 
 
412 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  31.21 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8360  Esterase/lipase-like protein  32.73 
 
 
362 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  33.6 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  30.95 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  30.95 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>