More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0304 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  100 
 
 
334 aa  677    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  97.31 
 
 
334 aa  661    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  34.06 
 
 
325 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  30.97 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  29.6 
 
 
303 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.63 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  29.79 
 
 
333 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  29.84 
 
 
269 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  29.56 
 
 
340 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  28.21 
 
 
323 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  31.28 
 
 
334 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  31.28 
 
 
334 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.42 
 
 
420 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.67 
 
 
321 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  30.86 
 
 
322 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  28.79 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.83 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.44 
 
 
1094 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  27.05 
 
 
337 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  24.9 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.37 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.39 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.63 
 
 
293 aa  90.1  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.04 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  24.7 
 
 
403 aa  89  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  25.29 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  25.48 
 
 
471 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.11 
 
 
426 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  29.11 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  24.16 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  26.98 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1048  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  27.93 
 
 
431 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.98 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.48 
 
 
645 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  24.85 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.53 
 
 
376 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.64 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  24.71 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.22 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11223  probable lipase  31.46 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.877155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.2 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.89 
 
 
407 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03310  esterase/lipase  24.26 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  25.4 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  23.89 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.89 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.09 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  26.72 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  27.82 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.38 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  25.64 
 
 
644 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  26.15 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.14 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  26.58 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  27.07 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.29 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2357  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.46 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00444827  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2048  esterase/lipase  25.18 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.25 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.82 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  26.7 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  25.37 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  23.44 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  27.31 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  25.62 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  23.53 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.41 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.39 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  24.54 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  27.87 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.29 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  24.02 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.15 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  24.8 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  24.8 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  24.8 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.13 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.27 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  22.27 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1546  esterase/lipase  23.64 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0472354  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.92 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  26.24 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  23.89 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  27.09 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  23.66 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.49 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  26.1 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  28.79 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5474  esterase/lipase  27.27 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0739  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.1 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.231286  hitchhiker  0.00721171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  34.23 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  25.79 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.58 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  22.1 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.7 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  23.05 
 
 
509 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  24.12 
 
 
271 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.18 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>