197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  36.86 
 
 
269 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  35.83 
 
 
299 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  38.04 
 
 
261 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  34.01 
 
 
245 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  36.51 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  32.91 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  34.96 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  36.94 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  35 
 
 
332 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  37.72 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  38.96 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  31.47 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  34.48 
 
 
309 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  36.82 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  34.83 
 
 
344 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  31.06 
 
 
268 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.56 
 
 
243 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  29.41 
 
 
238 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  36.29 
 
 
380 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  34.36 
 
 
270 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  30.8 
 
 
322 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  30.04 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  34.67 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  30.04 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  35.91 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  27.91 
 
 
307 aa  85.9  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  34.43 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  30.29 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  32.28 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  29.88 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  30.63 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  27.57 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  25.59 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  27.78 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.07 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  28.15 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  24.2 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  24.12 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.83 
 
 
347 aa  62.4  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  27.72 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  29.01 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1048  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.84 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  28.71 
 
 
333 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.9 
 
 
1094 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  26.72 
 
 
593 aa  58.9  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  27.27 
 
 
391 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  27.27 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  24.77 
 
 
644 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  33.65 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.77 
 
 
349 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  25.73 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  28.86 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.85 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  28.71 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  27.89 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.87 
 
 
323 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.59 
 
 
321 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  25.4 
 
 
376 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  27.83 
 
 
379 aa  55.8  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.63 
 
 
343 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  22.91 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  31.5 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  31.5 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  30.71 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  28.5 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.64 
 
 
426 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  29.84 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.87 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  23.28 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  24.27 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  22.45 
 
 
311 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  28.23 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.27 
 
 
307 aa  52.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  29.2 
 
 
324 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  26.15 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.93 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2048  esterase/lipase  24.53 
 
 
297 aa  52  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  29.05 
 
 
340 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  28.24 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  29.55 
 
 
322 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  27.78 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  32.17 
 
 
454 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  24.85 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.65 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  29.55 
 
 
334 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  26.02 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  29.55 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  24.26 
 
 
414 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  32.18 
 
 
325 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  24.26 
 
 
414 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  24.26 
 
 
414 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  30.63 
 
 
275 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  30.63 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.44 
 
 
319 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  33.68 
 
 
399 aa  49.3  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  24.5 
 
 
431 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  25 
 
 
317 aa  49.3  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  30.43 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>