112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4325 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  528  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  41.54 
 
 
299 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  43.04 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  37.72 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  39.02 
 
 
269 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  40.38 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  36.89 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  37.6 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  42.51 
 
 
264 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.3 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  37.1 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  37.28 
 
 
249 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  32.81 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  38.87 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  34.66 
 
 
273 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  36.4 
 
 
262 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  39.66 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  34.94 
 
 
322 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  34.98 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  28.9 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  32.6 
 
 
332 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  34.65 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  35.41 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  37 
 
 
344 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  37.7 
 
 
380 aa  89  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.74 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  33.46 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  31.28 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  35.22 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  28.46 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  28.57 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  30.33 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  39.34 
 
 
399 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  27.48 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  38.24 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  42.31 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  43.27 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.2 
 
 
299 aa  55.8  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.38 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.17 
 
 
683 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.42 
 
 
686 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.69 
 
 
571 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.46 
 
 
685 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  31.91 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  34.45 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  30.41 
 
 
274 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.67 
 
 
652 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.32 
 
 
687 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  23.61 
 
 
684 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0382  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.03 
 
 
569 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0110228  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  30.43 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.69 
 
 
683 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  31.84 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  31.67 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.46 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  34.91 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.46 
 
 
687 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361808  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.7 
 
 
583 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.61 
 
 
684 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.46 
 
 
684 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.64 
 
 
677 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  35.54 
 
 
593 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.46 
 
 
687 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.46 
 
 
687 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  33.18 
 
 
454 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.45 
 
 
635 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.16 
 
 
672 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  31.11 
 
 
306 aa  45.8  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  24.46 
 
 
687 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  26.89 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  30.56 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.22 
 
 
619 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0293  esterase/lipase  30.84 
 
 
381 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.51 
 
 
634 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  32.64 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  27.94 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2009  acylaminoacyl-peptidase  28.44 
 
 
618 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.951277  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  29.5 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  27.39 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.57 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.59 
 
 
642 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  29.38 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.61 
 
 
682 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  31.42 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.61 
 
 
683 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.61 
 
 
683 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  27.16 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.61 
 
 
683 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.45 
 
 
628 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.94 
 
 
688 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0182  hypothetical protein  28.28 
 
 
210 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  27.6 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.51 
 
 
649 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2691  hypothetical protein  29.38 
 
 
222 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.152088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2735  hypothetical protein  29.38 
 
 
222 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319377  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2721  hypothetical protein  29.38 
 
 
222 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252189  normal  0.630425 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.19 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.41 
 
 
762 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.84 
 
 
633 aa  43.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.57 
 
 
588 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>