126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1516 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  100 
 
 
270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  34.14 
 
 
269 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  32.68 
 
 
263 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  32.53 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  30.38 
 
 
322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  34.84 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  33.73 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  31.01 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  31.47 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29 
 
 
331 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  30.43 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  31.82 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  31.37 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  30.28 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  29.24 
 
 
309 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  29.27 
 
 
261 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  28.9 
 
 
291 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  29.17 
 
 
344 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  29.92 
 
 
355 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  30.04 
 
 
262 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  34.39 
 
 
264 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  31.7 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  29.96 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  26.79 
 
 
307 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  28.9 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  27.52 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.24 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  26.19 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  27.63 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  27.69 
 
 
380 aa  68.9  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  28.23 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.63 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  26.83 
 
 
411 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  27.78 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  25.3 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  27.15 
 
 
593 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  28.77 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  25.96 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  25.1 
 
 
376 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  24.56 
 
 
391 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.14 
 
 
406 aa  55.8  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  27.51 
 
 
314 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.39 
 
 
420 aa  55.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  27.85 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  24.63 
 
 
326 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  26.27 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.64 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  23.46 
 
 
274 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  26.12 
 
 
334 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  26.12 
 
 
322 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  26.16 
 
 
333 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  33.87 
 
 
454 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  26.29 
 
 
324 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  22.63 
 
 
328 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.14 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.9 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  25.91 
 
 
340 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  25.37 
 
 
334 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  28.33 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.59 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  21.79 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  25 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  28.7 
 
 
340 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.31 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.7 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.66 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  23.98 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.91 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.57 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.09 
 
 
288 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  25.97 
 
 
337 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1415  heroin esterase  30.17 
 
 
302 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0841271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  23.51 
 
 
274 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  30.43 
 
 
283 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  32.11 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  23.86 
 
 
644 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.83 
 
 
310 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  25.45 
 
 
339 aa  46.6  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  27.69 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  30.07 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  29.68 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.15 
 
 
301 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1048  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.7 
 
 
316 aa  45.8  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  24.19 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  24.15 
 
 
314 aa  45.4  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  28.17 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.81 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  26.7 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  31.75 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  26.73 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.34 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.85 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  22.78 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  23.97 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.12 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  26.87 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.3 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>