80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3160 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  36.26 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  36.09 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  33.47 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  30.31 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  32.42 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  36.58 
 
 		 322 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  37.78 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.76 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  38.79 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  31.4 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  33.89 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  33.98 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  29.27 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  33.95 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  27.91 
 
 		 379 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  30.42 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  30.23 
 
 		 307 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.07 
 
 		 331 aa  97.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.51 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  34.78 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  36.45 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  30.04 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  33.72 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  33.73 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  35.27 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  31.33 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  32.17 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  28.14 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.73 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.73 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.73 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  30.83 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  28.37 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.38 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.74 
 
 		 409 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.78 
 
 		 656 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  33.19 
 
 		 399 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.47 
 
 		 422 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  28.03 
 
 		 414 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  27.65 
 
 		 414 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  27.65 
 
 		 414 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  27.68 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  28.02 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.04 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  27.67 
 
 		 403 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  28.77 
 
 		 632 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  26.78 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.23 
 
 		 321 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 		 676 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.62 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.49 
 
 		 635 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  27.54 
 
 		 431 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8360  Esterase/lipase-like protein  33.72 
 
 		 362 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.51 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.19 
 
 		 406 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.54 
 
 		 655 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00781  esterase/lipase/thioesterase family protein  20.89 
 
 		 642 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.1 
 
 		 735 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.82 
 
 		 726 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.89 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.64 
 
 		 677 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  27.46 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  29.33 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  35.54 
 
 		 593 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  27.73 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.68 
 
 		 633 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.39 
 
 		 641 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.65 
 
 		 672 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  26.09 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  26.46 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  28.94 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  26.42 
 
 		 471 aa  42.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  22.95 
 
 		 318 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  24.11 
 
 		 645 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  29 
 
 		 308 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.2 
 
 		 677 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  25.36 
 
 		 568 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>