74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02409 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  100 
 
 
379 aa  790    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  38.68 
 
 
307 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  27.91 
 
 
261 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  32.89 
 
 
273 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  31.34 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.33 
 
 
243 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  33.33 
 
 
249 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  32.11 
 
 
268 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  28.85 
 
 
263 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  29.66 
 
 
269 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  29.18 
 
 
270 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  31.9 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  28.29 
 
 
262 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  32.33 
 
 
268 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.41 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  27.13 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  28.35 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  27.95 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  29.82 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  29.41 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.33 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  30.98 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  28.83 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  33.5 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  27.63 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.46 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  30.17 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1048  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.19 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  24.91 
 
 
299 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  28.69 
 
 
279 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.48 
 
 
407 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.48 
 
 
407 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.48 
 
 
407 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  28.84 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.34 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  27.83 
 
 
271 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.65 
 
 
652 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.41 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  27.92 
 
 
454 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  23.83 
 
 
403 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  30 
 
 
593 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  26.84 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.64 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.05 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.09 
 
 
333 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25 
 
 
311 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  26.32 
 
 
309 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3154  esterase/lipase/thioesterase  30.99 
 
 
289 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246115  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.07 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.71 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  27.81 
 
 
264 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.52 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.47 
 
 
828 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  25.57 
 
 
380 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.91 
 
 
645 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.91 
 
 
645 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3439  hypothetical protein  31.86 
 
 
324 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.27 
 
 
645 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  30.3 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  25.13 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  25.51 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  23.89 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.95 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  31.09 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  25.94 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.52 
 
 
1094 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.56 
 
 
336 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  23.01 
 
 
306 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.26 
 
 
347 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  27.8 
 
 
824 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.88 
 
 
755 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.37 
 
 
607 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  22.49 
 
 
645 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>