192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4844 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  100 
 
 
332 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  39.13 
 
 
331 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  38.11 
 
 
344 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  38.79 
 
 
262 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  35.71 
 
 
245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  35.63 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  34.51 
 
 
263 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  34.29 
 
 
269 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  34.87 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  35 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  31.01 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  33.81 
 
 
322 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  44.15 
 
 
264 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  33.76 
 
 
261 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  33.89 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  38.18 
 
 
309 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  35.34 
 
 
268 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  37.85 
 
 
221 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  32.26 
 
 
270 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  33.86 
 
 
291 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  30.31 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  33.47 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.06 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  34.3 
 
 
321 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  27.71 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  28.63 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  29.41 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  35.71 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  30.04 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  28.51 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  23.48 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  27.63 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  31.4 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  27.14 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.29 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  26.46 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.92 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.2 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.38 
 
 
308 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1833  esterase-like protein  25.45 
 
 
273 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.48 
 
 
312 aa  62.8  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  24.02 
 
 
704 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  25.13 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.04 
 
 
720 aa  59.7  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  29.1 
 
 
345 aa  59.7  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.73 
 
 
1094 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  37.5 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  26.89 
 
 
644 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.18 
 
 
672 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  27.1 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.36 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  28.46 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.69 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  26.81 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.22 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  24.68 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  27.48 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.45 
 
 
645 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  24.24 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0227  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.51 
 
 
604 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  27.49 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.67 
 
 
695 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.06 
 
 
701 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2009  acylaminoacyl-peptidase  31.96 
 
 
618 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.951277  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  27.73 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.47 
 
 
652 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36290  prolyl oligopeptidase family protein  28.15 
 
 
609 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278406  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  24.3 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  24.3 
 
 
654 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  34.17 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.3 
 
 
654 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.52 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  31.25 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  27.35 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0703  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.32 
 
 
621 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0447  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.02 
 
 
599 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0996  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  33.68 
 
 
771 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8360  Esterase/lipase-like protein  28.11 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  26.7 
 
 
334 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  29.6 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  24.17 
 
 
652 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  24.18 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.33 
 
 
683 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  25.4 
 
 
407 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.3 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11223  probable lipase  26.27 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.877155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  22.75 
 
 
684 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.4 
 
 
407 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.4 
 
 
407 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.33 
 
 
683 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.12 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.33 
 
 
683 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  21.4 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.7 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.73 
 
 
664 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.46 
 
 
682 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  23.89 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  30 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>