More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0703 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0227  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  57.52 
 
 
604 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0703  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  100 
 
 
621 aa  1226    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36290  prolyl oligopeptidase family protein  54.16 
 
 
609 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278406  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  53.91 
 
 
587 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0447  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  54.38 
 
 
599 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2009  acylaminoacyl-peptidase  50.5 
 
 
618 aa  552  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.951277  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0506  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  52.4 
 
 
595 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0403  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  47.98 
 
 
588 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.892602  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  48.34 
 
 
614 aa  485  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2293  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.76 
 
 
602 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.41 
 
 
656 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.01 
 
 
594 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.06 
 
 
646 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.89 
 
 
655 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.87 
 
 
668 aa  117  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.81 
 
 
638 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.56 
 
 
607 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  36.4 
 
 
649 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0440  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.67 
 
 
536 aa  115  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  33.33 
 
 
665 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  32.19 
 
 
759 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.46 
 
 
606 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30410  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  35.74 
 
 
702 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2289  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.3 
 
 
536 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.64 
 
 
617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.33 
 
 
632 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0382  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.41 
 
 
569 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0110228  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.91 
 
 
600 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.28 
 
 
628 aa  110  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.96 
 
 
735 aa  110  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.03 
 
 
597 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.25 
 
 
612 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.92 
 
 
665 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.47 
 
 
626 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.31 
 
 
607 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.78 
 
 
683 aa  107  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.69 
 
 
719 aa  107  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  36.84 
 
 
612 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.43 
 
 
626 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0240  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.5 
 
 
572 aa  106  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.393632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.09 
 
 
607 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.2 
 
 
644 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2294  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.48 
 
 
776 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237204  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.67 
 
 
638 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0608  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.92 
 
 
645 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.64 
 
 
633 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.43 
 
 
692 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.77 
 
 
644 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.81 
 
 
575 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1489  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
646 aa  104  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.475976  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.7 
 
 
629 aa  104  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.09 
 
 
653 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.75 
 
 
571 aa  103  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.04 
 
 
667 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.32 
 
 
626 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.1 
 
 
657 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.49 
 
 
720 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.94 
 
 
631 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.77 
 
 
641 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.84 
 
 
596 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.27 
 
 
643 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.72 
 
 
588 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  28.93 
 
 
618 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.94 
 
 
630 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.49 
 
 
626 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.49 
 
 
626 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.18 
 
 
626 aa  102  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.71 
 
 
656 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.55 
 
 
642 aa  101  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.88 
 
 
692 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.19 
 
 
653 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.61 
 
 
652 aa  101  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.16 
 
 
695 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.59 
 
 
642 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.94 
 
 
611 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41620  peptidase  32.94 
 
 
651 aa  99.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.46 
 
 
654 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.32 
 
 
646 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.89 
 
 
688 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.19 
 
 
651 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.56 
 
 
646 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.5 
 
 
668 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.77 
 
 
693 aa  98.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.04 
 
 
654 aa  98.6  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.82 
 
 
607 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.76 
 
 
653 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.36 
 
 
588 aa  98.2  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  33.19 
 
 
643 aa  97.8  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.8 
 
 
629 aa  97.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1344  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.89 
 
 
629 aa  97.4  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 
677 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2275  putative peptidase  33.58 
 
 
635 aa  97.4  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.573468  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.33 
 
 
677 aa  97.4  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  30.54 
 
 
640 aa  97.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  31.44 
 
 
661 aa  97.1  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  32.51 
 
 
642 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.31 
 
 
661 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.92 
 
 
649 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0587  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.82 
 
 
623 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  30.54 
 
 
655 aa  96.3  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>