More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0404 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  91.43 
 
 
612 aa  1125    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0508  hypothetical protein  67.21 
 
 
610 aa  792    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4675  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  66.94 
 
 
608 aa  806    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637214  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5162  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  66.32 
 
 
574 aa  757    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  83.31 
 
 
607 aa  1026    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  92.07 
 
 
607 aa  1118    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
607 aa  1241    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41620  peptidase  54.7 
 
 
651 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38770  putative peptidase  52.29 
 
 
608 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.24 
 
 
652 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  51.8 
 
 
608 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.68 
 
 
646 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.52 
 
 
643 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.19 
 
 
644 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.6 
 
 
643 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  39.04 
 
 
643 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.12 
 
 
644 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.96 
 
 
644 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.85 
 
 
644 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1344  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.19 
 
 
629 aa  359  9e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.3 
 
 
655 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.48 
 
 
644 aa  352  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0459  prolyl oligopeptidase family protein  34.74 
 
 
636 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1709  peptidase catalytic subunit  34.74 
 
 
636 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  34.31 
 
 
665 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.63 
 
 
642 aa  333  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0608  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  39.38 
 
 
645 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.99 
 
 
693 aa  320  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.55 
 
 
683 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.73 
 
 
662 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.956519  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1383  prolyl oligopeptidase family protein  34.15 
 
 
686 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.87 
 
 
677 aa  300  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.48 
 
 
677 aa  296  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.48 
 
 
677 aa  296  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1686  prolyl oligopeptidase family protein  32.7 
 
 
678 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.65 
 
 
643 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.45 
 
 
676 aa  293  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  33.86 
 
 
661 aa  292  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.33 
 
 
682 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.33 
 
 
682 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.33 
 
 
682 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.33 
 
 
682 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.87 
 
 
683 aa  290  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1489  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.35 
 
 
646 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.475976  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03061  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.28 
 
 
652 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.01 
 
 
675 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.453566  normal  0.217574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.63 
 
 
626 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.5 
 
 
719 aa  280  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3161  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.49 
 
 
662 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464305  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.18 
 
 
677 aa  267  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.7 
 
 
668 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00771  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.93 
 
 
645 aa  263  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.248963  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0587  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.16 
 
 
623 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0408  putative peptidase  34.56 
 
 
639 aa  257  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2275  putative peptidase  33.88 
 
 
635 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.573468  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19830  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.81 
 
 
641 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646279  hitchhiker  0.000217512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30410  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  31.67 
 
 
702 aa  237  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01331  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.97 
 
 
644 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.180596  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1432  dienelactone hydrolase  26.16 
 
 
644 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.839365  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00781  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.84 
 
 
642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.77 
 
 
663 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956088  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1960  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.93 
 
 
610 aa  207  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.317631  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0071  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.92 
 
 
641 aa  193  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3453  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.1 
 
 
640 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000252279  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00801  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.81 
 
 
641 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00811  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.66 
 
 
641 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  31.85 
 
 
655 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  30.03 
 
 
638 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  31.36 
 
 
640 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  30.42 
 
 
657 aa  137  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.27 
 
 
656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  34.4 
 
 
678 aa  133  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.06 
 
 
656 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.92 
 
 
652 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
653 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.13 
 
 
600 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.38 
 
 
597 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.37 
 
 
638 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.63 
 
 
610 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.3 
 
 
615 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.84 
 
 
634 aa  127  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.14 
 
 
606 aa  127  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  31.8 
 
 
646 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.8 
 
 
630 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.45 
 
 
652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.07 
 
 
594 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.49 
 
 
907 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.45 
 
 
649 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.83 
 
 
665 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  28.52 
 
 
642 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.79 
 
 
655 aa  117  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.52 
 
 
660 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.6 
 
 
644 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4496  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.18 
 
 
657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.597999  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  31.36 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.63 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.95 
 
 
634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.87 
 
 
706 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.98 
 
 
626 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.71 
 
 
667 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>