More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02110 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  100 
 
 		 399 aa  779    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 136 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  52.59 
 
 		 136 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 		 159 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  51.45 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 		 139 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 137 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 137 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 137 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  51.26 
 
 		 136 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 144 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 137 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  42.34 
 
 		 152 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  52.43 
 
 		 134 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 		 149 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  43.41 
 
 		 152 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  37.22 
 
 		 268 aa  96.3  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 139 aa  96.3  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  45.16 
 
 		 136 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  39.19 
 
 		 262 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 134 aa  93.2  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  36.96 
 
 		 268 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  39.1 
 
 		 270 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 141 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 		 132 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 142 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  46.85 
 
 		 149 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  42.07 
 
 		 354 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  29.21 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  40.18 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  49.53 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  33.78 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  33.95 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  32.63 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  42.45 
 
 		 129 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 129 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  42.45 
 
 		 129 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  32.56 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  37.89 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 132 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  44.44 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  32.74 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.28 
 
 		 243 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  37.04 
 
 		 132 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  36.84 
 
 		 141 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 137 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  39.34 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  28.29 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  31.39 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  31.21 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.96 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  32.77 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  31.91 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  30.91 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  34.2 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 167 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 131 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 131 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  35.43 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  30.08 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  35.16 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 140 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  32.35 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  34.56 
 
 		 160 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  32.64 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  34.56 
 
 		 160 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 156 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  30 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  39.45 
 
 		 163 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 156 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  32.99 
 
 		 133 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 156 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 197 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 130 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.02 
 
 		 312 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.59 
 
 		 288 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  33.59 
 
 		 160 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 155 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  33.59 
 
 		 160 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 135 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  33.59 
 
 		 160 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 160 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 157 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  33.91 
 
 		 157 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 141 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 151 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 126 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>