225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1594 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  100 
 
 
134 aa  273  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  71.43 
 
 
137 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 
132 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
136 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  46.15 
 
 
141 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  44.36 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  40.31 
 
 
130 aa  103  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
126 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 
130 aa  90.1  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  39.32 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  37.37 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  37.37 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  39.13 
 
 
399 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  40.91 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
398 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  34.45 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  34.86 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  34.86 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
149 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  48.33 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  48.15 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  34.4 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  32.46 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  46.67 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  46.67 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
149 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.69 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  31.62 
 
 
132 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
166 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  33.33 
 
 
141 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  45 
 
 
132 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  44.64 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
144 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  52.27 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  48.94 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  48.94 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  48.94 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  44.64 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  44.64 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  44.64 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  44.64 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.65 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.63 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  45 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  46.81 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  63.33 
 
 
318 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  29.92 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.83 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  33 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>