More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4350 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 137 aa  270  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  94.89 
 
 		 137 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  94.16 
 
 		 137 aa  254  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  85.4 
 
 		 137 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  70.08 
 
 		 136 aa  173  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  67.16 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  67.44 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  54.01 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  54.4 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  52.03 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  49.26 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  51.22 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  46.97 
 
 		 399 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 398 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  51.89 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  51.89 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  54.26 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  46.73 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  49.54 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  44.53 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  40.74 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  41.53 
 
 		 354 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  39.45 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.51 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  34.62 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  33.08 
 
 		 329 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  33.08 
 
 		 329 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  32.39 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  29.37 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  31.78 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  34.04 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.5 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  31.67 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  33.1 
 
 		 314 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  29.23 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  31.97 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  33.58 
 
 		 347 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  31.97 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  29.31 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  27.43 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  33.05 
 
 		 334 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  31.97 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  27.43 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 334 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  31.97 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  31.97 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  31.34 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  25.98 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  28.7 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  33.63 
 
 		 318 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  30.83 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  27.43 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  31.5 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  37.25 
 
 		 315 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>