More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0090 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  296  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  296  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  296  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  98.63 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  92.11 
 
 		 152 aa  276  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  92.11 
 
 		 152 aa  276  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  87.25 
 
 		 153 aa  257  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  83.92 
 
 		 334 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  84.62 
 
 		 149 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  84.62 
 
 		 149 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  84.62 
 
 		 149 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  84.62 
 
 		 149 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  83.92 
 
 		 149 aa  246  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  83.92 
 
 		 149 aa  246  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  83.56 
 
 		 149 aa  245  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  76.03 
 
 		 142 aa  224  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  80.45 
 
 		 141 aa  222  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  74.83 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  66.44 
 
 		 153 aa  204  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  73.64 
 
 		 142 aa  200  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  69.57 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  67.16 
 
 		 149 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  62.22 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  60.14 
 
 		 151 aa  166  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  58.91 
 
 		 159 aa  156  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  57.03 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  57.03 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  58.27 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  57.69 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  55.64 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  55.3 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  60.68 
 
 		 312 aa  143  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  54.62 
 
 		 314 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  52 
 
 		 325 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  48.8 
 
 		 310 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  50.78 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  46.67 
 
 		 329 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  46.67 
 
 		 329 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  52.73 
 
 		 313 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  53.4 
 
 		 316 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  52.43 
 
 		 314 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  48.54 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  42.47 
 
 		 347 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  45.13 
 
 		 315 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  51.46 
 
 		 314 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  51.46 
 
 		 314 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  51.46 
 
 		 314 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  43.38 
 
 		 314 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  45.3 
 
 		 315 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  45.69 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  41.91 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.58 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  48.54 
 
 		 316 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  45.97 
 
 		 315 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  41.13 
 
 		 317 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.88 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  47.57 
 
 		 313 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  42.54 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  44.26 
 
 		 319 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  45.63 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  43.2 
 
 		 315 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  45.63 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  36.3 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.01 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  41.09 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  41.09 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  37.96 
 
 		 318 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.76 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.21 
 
 		 302 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  40.46 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  44.23 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.76 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  44.66 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.2 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  42.06 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  40 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  42.64 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.57 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.35 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.35 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  41.35 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  44.33 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  41.59 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  44.66 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>