242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0229 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  100 
 
 		 141 aa  284  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  55.81 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  55 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 138 aa  116  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  45.13 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  35.43 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  41 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  36.84 
 
 		 399 aa  68.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  38.3 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  36.54 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  40.18 
 
 		 354 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.94 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  41.58 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.61 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  47.06 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  46.03 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.33 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.33 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.33 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  31.13 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  42.22 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  46.27 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  46.27 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  48.48 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  35.63 
 
 		 305 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  41.03 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  41.03 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  41.38 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  35.81 
 
 		 322 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  45.45 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  35.42 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0577  hypothetical protein  44.9 
 
 		 51 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  32.64 
 
 		 329 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  32.64 
 
 		 329 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  43.08 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  39.08 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  45.45 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>