More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1163 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  54.74 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  54.01 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  54.01 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  50.39 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 398 aa  97.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  39.2 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  44.92 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  44.92 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  44.27 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  42.86 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  42.61 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  42.52 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  42.4 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  49.45 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  40.18 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  33.63 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  36.27 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  38.18 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  31.97 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  41.94 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  36.54 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  34.38 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  32.74 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  30.4 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  33.67 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  33.67 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  33.67 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  31.53 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  31.73 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  40.32 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.54 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.83 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  49.15 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 329 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  34.78 
 
 		 314 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  35.92 
 
 		 316 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  37.21 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  47.37 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  47.37 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  47.37 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  47.37 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  47.37 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  34.04 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  37.21 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.08 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  36.36 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  34.69 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.38 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  27.19 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  36.36 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.14 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  47.37 
 
 		 334 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  30 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.44 
 
 		 313 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.21 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>