More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4342 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  314  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  48.36 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 193 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  45.27 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  44.59 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  44.59 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  43.94 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 175 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 175 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  35.16 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.43 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  32.41 
 
 		 524 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  34.44 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  34.44 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  34.44 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 188 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  31.48 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  45.88 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  35.29 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  35.29 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  34.78 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  35.78 
 
 		 312 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  35.9 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.4 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  26.98 
 
 		 207 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  39.81 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  34.51 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  27.54 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32.48 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  32.22 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  36.75 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  32.22 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  32.71 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  34.21 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  39.81 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  33.04 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  36.63 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  34.56 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>