More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3543 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  51.03 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  46.5 
 
 		 157 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  50.66 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  49.65 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  51.63 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  46.45 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  47.77 
 
 		 163 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  46.67 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5571  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0243609  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1309  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  33.08 
 
 		 153 aa  90.9  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  33.08 
 
 		 153 aa  90.9  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  33.08 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  33.08 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  32.31 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  32.61 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  33.08 
 
 		 229 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  35.33 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  35.33 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  35.33 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  35.33 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  35.33 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  35.17 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  35.17 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  35.86 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  35.86 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  36.02 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  33.82 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  31.03 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  33.09 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  34.03 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  34.25 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  34.25 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  33.56 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  33.56 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  33.09 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  27.89 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  34.81 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  31.17 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  31.82 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  27.21 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  33 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  26.53 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  37.63 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  33.09 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  28.36 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  27.21 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  25.85 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  27.7 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  27.7 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  30 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  29.01 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.4 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  29.77 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  29.77 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1730  ADP-ribose pyrophosphatase  33.1 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  28.24 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.78 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  33.85 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>