More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4253 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  100 
 
 
160 aa  332  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  50 
 
 
156 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 
156 aa  177  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 
156 aa  177  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
155 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
155 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  49.68 
 
 
158 aa  168  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 
155 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 
155 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 
155 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  50 
 
 
155 aa  164  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  47.74 
 
 
158 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  49.35 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
158 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  43.23 
 
 
158 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.95 
 
 
159 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  40 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
155 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  31.65 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  47.5 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  46.25 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
209 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  37.27 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  48.15 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  31.78 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  34.83 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  34.83 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  34.83 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  35.63 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  29.41 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  39.82 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  33.33 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  28.68 
 
 
205 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  50.75 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  37.74 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  40 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  28.68 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  28.68 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  46.27 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  28.68 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  28.68 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  32.26 
 
 
212 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
236 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
205 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  28.15 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  45.45 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
216 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  28.15 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
141 aa  62.4  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 
215 aa  62.4  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  36 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  47.44 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
205 aa  61.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>