More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2047 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  100 
 
 
156 aa  310  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 
151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  63.12 
 
 
149 aa  174  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  61.54 
 
 
146 aa  170  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  58.9 
 
 
150 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  59.4 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
150 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  56.3 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  57.69 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  57.04 
 
 
140 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  49.24 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  54.96 
 
 
142 aa  133  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  50 
 
 
148 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  53.08 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  58.73 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  54.33 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  59.29 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  50 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 
144 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 
140 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  59.7 
 
 
132 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  54.62 
 
 
157 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 
135 aa  124  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  50 
 
 
143 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
137 aa  121  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 
137 aa  120  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
171 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
171 aa  116  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  51.82 
 
 
212 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 
176 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  50 
 
 
156 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 
236 aa  94.7  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  44.68 
 
 
237 aa  91.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  39.26 
 
 
137 aa  87.4  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 
240 aa  87  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
231 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
229 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
228 aa  77.8  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  50.56 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  43.36 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  39.23 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 
362 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  40 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.51 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  37.4 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
303 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
233 aa  67.4  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
226 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.39 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  41 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.39 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  41 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  41 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.38 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
225 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  34.45 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
286 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>