More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0988 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  74.5 
 
 		 150 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  76.55 
 
 		 150 aa  227  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  69.8 
 
 		 150 aa  225  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  69.8 
 
 		 150 aa  224  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  71.72 
 
 		 157 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  61.27 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  62.88 
 
 		 148 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  62.12 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  61.36 
 
 		 148 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  65.35 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  56.94 
 
 		 153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  62.88 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  61.94 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  55.71 
 
 		 166 aa  150  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  55.8 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  56.83 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  50.36 
 
 		 212 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 171 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  51.55 
 
 		 176 aa  134  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  57.69 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  54.1 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  49.19 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 		 236 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  46.9 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  41.22 
 
 		 237 aa  95.5  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 229 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 240 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 252 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  41.41 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  30.53 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  30.53 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  30.53 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  31.97 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  40.62 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  32.23 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1798  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 362 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  29.01 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  28.24 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  44.68 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.92 
 
 		 355 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  31.93 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  31.93 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 260 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 248 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 269 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 186 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.69 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  31.51 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 273 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  41.18 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 303 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>