More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2421 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  67.7 
 
 		 230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  52.44 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  51.14 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  48.86 
 
 		 229 aa  222  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.99 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  42.18 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  39.91 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 219 aa  162  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  37.73 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 251 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  35.69 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  36.24 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  30.74 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 257 aa  131  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 320 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  35.44 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  34.05 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  34.53 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  28.51 
 
 		 251 aa  121  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 257 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  34.2 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  34.15 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  44.12 
 
 		 137 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  34.05 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  30.91 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  30.62 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 242 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  33.98 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  33.17 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  30.8 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 		 662 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  31.68 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  30.94 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  27.04 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  34 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>