146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4400 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  49.37 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  42.56 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 237 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 		 229 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  33.2 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  30.74 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  32.64 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 231 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  31.44 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  31.38 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  30.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  30.04 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  29.74 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  30.26 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  28.63 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 251 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  26.32 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  27.95 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  26.25 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  25.86 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  25.98 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  24.23 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  24.5 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  24.89 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  25.23 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  24 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  24.4 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  22.66 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  24.51 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  22.66 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  22.66 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  25.43 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  27.23 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  24.63 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  27.62 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  23.18 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  26.56 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  25.4 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  24.32 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  23.41 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  25.74 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  22.91 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>