More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8962 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  100 
 
 
244 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  72.69 
 
 
273 aa  328  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  58.17 
 
 
263 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  66.19 
 
 
226 aa  248  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  54.98 
 
 
248 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  54.08 
 
 
242 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  55.46 
 
 
286 aa  222  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  52.56 
 
 
662 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  51.6 
 
 
269 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  53.75 
 
 
260 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  52.25 
 
 
232 aa  215  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  53.3 
 
 
221 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  46.86 
 
 
320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  54.67 
 
 
223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 
219 aa  211  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  54.82 
 
 
231 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  53.65 
 
 
249 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  57.21 
 
 
229 aa  198  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  50.22 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 
251 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
248 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
240 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  46.29 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 
252 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
267 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  43.6 
 
 
229 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  57.05 
 
 
186 aa  161  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  40 
 
 
229 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
284 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
239 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 
219 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
231 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
229 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
225 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
238 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
228 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
229 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  41.63 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
243 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  41.15 
 
 
240 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  42.79 
 
 
228 aa  131  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  39.92 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
225 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 
244 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  36.11 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  36.68 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
234 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
251 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  38.98 
 
 
245 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  40 
 
 
255 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
252 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
237 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
233 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 
234 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 
233 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
231 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
233 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
236 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
248 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  34.55 
 
 
236 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  37.62 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 
223 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
232 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
232 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
251 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  39.27 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  41.01 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 
243 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  32.56 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 
233 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  38.5 
 
 
255 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  38.93 
 
 
137 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
222 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
245 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
229 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  39.11 
 
 
244 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
242 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
202 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  47.66 
 
 
224 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
253 aa  101  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
267 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>