161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0357 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  100 
 
 
257 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  52.12 
 
 
258 aa  256  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 
257 aa  245  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  48.52 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  49.37 
 
 
257 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 
254 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  42.56 
 
 
248 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
244 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
254 aa  175  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
251 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  37.13 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
271 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
229 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
229 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
229 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 
229 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
230 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
231 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
229 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
242 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
236 aa  138  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 
225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
233 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
248 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
234 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 
233 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  31.6 
 
 
234 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
240 aa  123  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 
228 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
244 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
233 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
233 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
240 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  31.44 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
267 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  32.13 
 
 
219 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
236 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
251 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 
236 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
249 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 
251 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
239 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
202 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
225 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
284 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  24.83 
 
 
303 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  30.41 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  28.81 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
219 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 
237 aa  85.9  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  27.35 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  29.17 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  29.07 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  28.5 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  27.18 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  26.75 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  28.51 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  29.3 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  26.58 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  25.31 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  25.48 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  26.48 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  25.63 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  27.23 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3688  NUDIX hydrolase  27.51 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.649761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  26.5 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  27 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  23.21 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  22.74 
 
 
320 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  27.09 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  26.2 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5180  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 
216 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  22.87 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  26.2 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>