More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3126 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  53.92 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 252 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  39.15 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  37.73 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 231 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  33.45 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 		 255 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  33.69 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  33.21 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  50.36 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 228 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 219 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 236 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  31.32 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  30.31 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  32.25 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 249 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  30.34 
 
 		 237 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 		 229 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  30.48 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  31.09 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 231 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  30.37 
 
 		 228 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  31.6 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 263 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 231 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  32.79 
 
 		 275 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 225 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  28.11 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 246 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 230 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  32.14 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  29.12 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  29.96 
 
 		 237 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 242 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 251 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 251 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  29.52 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  29.96 
 
 		 234 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 186 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 233 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0294  hypothetical protein  27.88 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199627 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  30.48 
 
 		 224 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 		 244 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 233 aa  99  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 233 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  27.65 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  40.32 
 
 		 137 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 254 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1233  hypothetical protein  31.27 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  26.35 
 
 		 251 aa  95.9  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4335  hypothetical protein  29.55 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.229695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  24.83 
 
 		 257 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1112  hypothetical protein  30.47 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0529668  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 234 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0167  hypothetical protein  27.52 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0123154  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2214  hypothetical protein  30.16 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263003  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  26.88 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1540  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3495  hypothetical protein  30.51 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 238 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2423  hypothetical protein  30.62 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 229 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0910  ADP-ribose pyrophosphatase  26.15 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0799533  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>