More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 269 aa  118  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 303 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 186 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  36.74 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 		 267 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 171 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  39.37 
 
 		 137 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  38.97 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 		 135 aa  99.8  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  43.66 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 171 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 286 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  40 
 
 		 144 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 320 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  38.85 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 139 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 137 aa  89.4  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  41.67 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 150 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 662 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 154 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 165 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 179 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 248 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 		 244 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 246 aa  85.1  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  34.38 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  43.48 
 
 		 146 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  48.11 
 
 		 143 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  46.23 
 
 		 143 aa  81.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  50.56 
 
 		 132 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  43.27 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  41.07 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.93 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  41.23 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  41.23 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  41.23 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.49 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.18 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  44.86 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  43.24 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.73 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.58 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  47.86 
 
 		 140 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>