More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2862 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  100 
 
 
186 aa  362  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  65.73 
 
 
269 aa  216  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  58.43 
 
 
273 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  52.87 
 
 
248 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
320 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
286 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  57.05 
 
 
244 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  54.11 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  52.81 
 
 
260 aa  131  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 
232 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 
246 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
662 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  55.73 
 
 
229 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  50.93 
 
 
251 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  51.66 
 
 
231 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 
248 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  47.44 
 
 
229 aa  121  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 
229 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  48.75 
 
 
242 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 
229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  43.95 
 
 
240 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  45.64 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 
219 aa  111  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  47.65 
 
 
223 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 
267 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  46.95 
 
 
243 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 
284 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  37.76 
 
 
137 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
303 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 
231 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
239 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  36.25 
 
 
250 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
228 aa  98.2  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  40 
 
 
267 aa  97.8  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  38.27 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
230 aa  95.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
135 aa  90.1  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
225 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
165 aa  88.2  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  40.97 
 
 
154 aa  87.8  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  39.24 
 
 
252 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
229 aa  85.9  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 
237 aa  85.9  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  33.76 
 
 
237 aa  85.5  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 
244 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
255 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 
171 aa  84.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0154  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
238 aa  81.3  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  34 
 
 
144 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  40.97 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
231 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
255 aa  79  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
233 aa  77  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  36.42 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
139 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  38.55 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0910  ADP-ribose pyrophosphatase  27.46 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0799533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.66 
 
 
351 aa  72  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  34.97 
 
 
243 aa  72  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  39.84 
 
 
342 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>