More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2844 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  100 
 
 
342 aa  707    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  42.27 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  42.27 
 
 
344 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5608  cytidyltransferase-like protein  42.33 
 
 
378 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400356 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.19 
 
 
338 aa  245  9e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  40.47 
 
 
348 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.36 
 
 
349 aa  239  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.66 
 
 
355 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.27 
 
 
362 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0228  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.21 
 
 
356 aa  236  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4845  cytidyltransferase-like protein  40.29 
 
 
353 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.76 
 
 
346 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.69 
 
 
346 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.69 
 
 
346 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.1 
 
 
346 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.69 
 
 
346 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.69 
 
 
346 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  40.41 
 
 
355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.35 
 
 
345 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  38.01 
 
 
358 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.3 
 
 
351 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1837  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.97 
 
 
367 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1324  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.97 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
165 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  40.65 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1231  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  29.14 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
165 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 
229 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1732  cytidyltransferase-like protein  30.34 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.301192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  40.18 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2370  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30 
 
 
170 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
246 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
242 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0276  cytidyltransferase-like protein  29.07 
 
 
176 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000121135  hitchhiker  0.0000263828 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1647  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.01 
 
 
178 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.439426  hitchhiker  0.00326189 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0591  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.25 
 
 
178 aa  64.3  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
233 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  29.91 
 
 
163 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0898  cytidyltransferase-like protein  28.19 
 
 
175 aa  63.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
179 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1561  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.59 
 
 
177 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.503576  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1824  cytidyltransferase-like protein  25.95 
 
 
170 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.280522  normal  0.585834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
240 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  37.38 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
249 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1625  cytidyltransferase-like protein  26.44 
 
 
168 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
229 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
171 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
221 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0960  cytidyltransferase-like protein  29.09 
 
 
176 aa  60.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0025996 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
236 aa  60.1  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
252 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0405  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.01 
 
 
178 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0606  NUDIX hydrolase  25.63 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  0.376937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 
260 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1430  cytidyltransferase-like protein  26.55 
 
 
171 aa  59.3  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
225 aa  59.3  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
252 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 
171 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
248 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1092  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.01 
 
 
171 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.925806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
171 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0898  cytidyltransferase-like protein  27.01 
 
 
171 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.996756  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  30 
 
 
250 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  31.86 
 
 
132 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
662 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0794  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.24 
 
 
177 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  27.01 
 
 
171 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0825  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  26.44 
 
 
171 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.518512  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 
137 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
219 aa  56.6  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
141 aa  56.2  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
136 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  37.93 
 
 
173 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
139 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
139 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
154 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  35.71 
 
 
144 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0834  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  40.26 
 
 
170 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.17 
 
 
473 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1647  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
157 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.654975  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  34.33 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 
140 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>