291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3717 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  100 
 
 
355 aa  725    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  70.25 
 
 
358 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  58.6 
 
 
344 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  60.12 
 
 
348 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  58.6 
 
 
344 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4845  cytidyltransferase-like protein  54.86 
 
 
353 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5608  cytidyltransferase-like protein  50.84 
 
 
378 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400356 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.9 
 
 
338 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.09 
 
 
351 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.52 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.23 
 
 
345 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.24 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.64 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.24 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.94 
 
 
346 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.94 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.94 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0228  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.82 
 
 
356 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  40.41 
 
 
342 aa  223  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.18 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.73 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.06 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1837  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.16 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
165 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1324  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.33 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
248 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  41.09 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  40 
 
 
273 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
171 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
132 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
229 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
139 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
249 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 
135 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
260 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  32.77 
 
 
144 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
226 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
162 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
236 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  40 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
252 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
139 aa  63.5  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
229 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  36 
 
 
248 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
662 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0606  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  0.376937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
228 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
154 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  36 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
173 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
252 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
231 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 
141 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
212 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
153 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
152 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
136 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
150 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1231  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  38.46 
 
 
172 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  31.3 
 
 
146 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
165 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  38.33 
 
 
232 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
284 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
152 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1732  cytidyltransferase-like protein  31.33 
 
 
164 aa  56.6  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.301192 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
137 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
141 aa  56.2  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6270  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
195 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
219 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
240 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
134 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2823  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.37 
 
 
172 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
154 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  35.64 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
149 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
231 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
182 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
188 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2201  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  37.8 
 
 
168 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0861  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  34.94 
 
 
172 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
169 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  33.57 
 
 
250 aa  53.9  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0834  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  34.52 
 
 
170 aa  53.9  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  48.33 
 
 
139 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
146 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1582  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.37 
 
 
168 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
136 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
146 aa  52.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>