More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1043 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  100 
 
 
229 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  73.36 
 
 
229 aa  355  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  67.69 
 
 
229 aa  323  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  62.77 
 
 
231 aa  298  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  53.64 
 
 
228 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  50.23 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  50.92 
 
 
245 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  51.6 
 
 
230 aa  222  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 
240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  49.07 
 
 
229 aa  221  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  49.55 
 
 
242 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  53.62 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  53.14 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  46.12 
 
 
245 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  48.86 
 
 
233 aa  209  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  43.69 
 
 
231 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 
225 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  54.81 
 
 
239 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  49.53 
 
 
219 aa  198  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  43.58 
 
 
229 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 
237 aa  193  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
234 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 
233 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
233 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  47.58 
 
 
267 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
284 aa  184  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  37.73 
 
 
303 aa  184  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
251 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  44.69 
 
 
233 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
254 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 
233 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  45.25 
 
 
251 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  45 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
251 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 
257 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
244 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
249 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
254 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
259 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
240 aa  159  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
255 aa  158  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 
257 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 
248 aa  154  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 
255 aa  154  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
251 aa  154  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
255 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  44.74 
 
 
228 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 
202 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 
248 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  41.47 
 
 
252 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
269 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 
252 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
236 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
236 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 
226 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
219 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 
251 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
231 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  41.51 
 
 
232 aa  144  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
244 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  40.19 
 
 
260 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  39.17 
 
 
237 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
237 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  43.59 
 
 
244 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
286 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
273 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  42.23 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  43.48 
 
 
275 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  37.85 
 
 
243 aa  134  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
662 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
242 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
249 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  39.59 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  33.47 
 
 
251 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  46.21 
 
 
137 aa  126  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
234 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  36.41 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>