280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0695 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  73.98 
 
 
251 aa  370  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  46.42 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  50.47 
 
 
237 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  48.61 
 
 
260 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 
269 aa  178  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 
240 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 
248 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
284 aa  168  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
242 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  49.3 
 
 
226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  47.87 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  44.69 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
320 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
252 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
263 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  42.8 
 
 
249 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
246 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  41.7 
 
 
662 aa  158  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  45.31 
 
 
244 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 
223 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 
252 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
229 aa  154  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
303 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
231 aa  148  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
229 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
255 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
231 aa  141  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
259 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  43.68 
 
 
239 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  38.49 
 
 
255 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 
225 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
243 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
250 aa  124  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
229 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 
186 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  36.04 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
233 aa  118  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  37.06 
 
 
252 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
230 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
244 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
238 aa  115  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  34.5 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
237 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 
236 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 
236 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
251 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
248 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
245 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
229 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  35.48 
 
 
243 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  39.29 
 
 
275 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
231 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
251 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
234 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  35 
 
 
249 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
233 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
202 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
236 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
244 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
233 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
242 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 
234 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
233 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
233 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
237 aa  99  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
222 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  48.18 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  35.93 
 
 
228 aa  95.9  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  36.36 
 
 
137 aa  95.5  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  35.44 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 
267 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
232 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
232 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
234 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  31.7 
 
 
234 aa  92  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0910  ADP-ribose pyrophosphatase  28.46 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0799533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
179 aa  89.4  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
171 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>