More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1086 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 
137 aa  144  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  55.2 
 
 
144 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 
166 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 
171 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  50 
 
 
135 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  51.64 
 
 
139 aa  126  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 
171 aa  124  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  51.45 
 
 
153 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 
212 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
132 aa  118  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
150 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  51.54 
 
 
156 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  48.03 
 
 
150 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 
137 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  50 
 
 
140 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 
149 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
148 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  43.18 
 
 
146 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  48.06 
 
 
140 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
142 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
148 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 
140 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
229 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
144 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 
143 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
229 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
157 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 
229 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 
150 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
130 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  41.94 
 
 
137 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
157 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
143 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 
154 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  46.26 
 
 
176 aa  92  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
150 aa  89.7  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  46.22 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
151 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.17 
 
 
345 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.17 
 
 
345 aa  85.9  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.4 
 
 
346 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.4 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.48 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.6 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.6 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.6 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.6 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.75 
 
 
362 aa  82  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 
138 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
151 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
178 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  43 
 
 
135 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  42.57 
 
 
116 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  41.3 
 
 
108 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  43.43 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.37 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.98 
 
 
349 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 
141 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  43.56 
 
 
111 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  39.22 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  47.13 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  36.76 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  31.65 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.29 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  33.33 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
145 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  40 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  38 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
136 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
136 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>