More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0877 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  63.97 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  63.71 
 
 		 135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  55.28 
 
 		 171 aa  144  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  53.97 
 
 		 171 aa  141  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  55.2 
 
 		 236 aa  140  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 166 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  47.73 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  54.69 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  50.4 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  54.26 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  51.24 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  46.77 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  53.54 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 212 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 229 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 229 aa  99.4  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  40.16 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 252 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 237 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 176 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 229 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 228 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 252 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 240 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 219 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  49.44 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 		 246 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  38.64 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 248 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  42.86 
 
 		 244 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  39.23 
 
 		 237 aa  77.4  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  36.11 
 
 		 250 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  36.51 
 
 		 232 aa  77  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 662 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 284 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 233 aa  73.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 320 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  36.57 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 265 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  32.79 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  36.11 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>