150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0033 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  52.54 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  49.58 
 
 		 139 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  46.15 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  46.49 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  42.05 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  39.39 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  41.18 
 
 		 195 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  48.19 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  34.58 
 
 		 245 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  31.82 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  34.58 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  34.58 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  33.63 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  31.48 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  31.78 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  45.76 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  34.41 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 258 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  36.14 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  34.34 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  43.48 
 
 		 257 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 278 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  32.61 
 
 		 263 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 		 247 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  35.24 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  46.81 
 
 		 269 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  40.32 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  40.98 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  34.48 
 
 		 114 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  37.14 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  37.14 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 281 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 281 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 269 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.59 
 
 		 368 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  31.25 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 278 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.59 
 
 		 368 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 276 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.59 
 
 		 368 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  35.53 
 
 		 272 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  28.57 
 
 		 269 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  32.93 
 
 		 265 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  42.11 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 279 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  31.87 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1625  molybdate transport repressor  35.37 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  52.38 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0896  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.94 
 
 		 365 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.71 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 279 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.71 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 278 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  43.06 
 
 		 366 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0446  molybdate transport repressor  35.37 
 
 		 344 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3008  regulatory protein  35.37 
 
 		 344 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  26.53 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2591  molybdate transport repressor  35.37 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0963  molybdate transport repressor  35.37 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2898  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2960  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0184  molybdate transport repressor  35.37 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  43.06 
 
 		 366 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  46.51 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  36.59 
 
 		 345 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.37 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  37.8 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  32.97 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3787  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 358 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.78 
 
 		 366 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  35.35 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0932  regulatory protein, LysR  41.79 
 
 		 365 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  33.33 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>