153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1565 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  58.26 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 171 aa  120  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  45.69 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  42.62 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  30.84 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  36.27 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  34.83 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  44.3 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  35.42 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  41.94 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  36.89 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 269 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  34.53 
 
 		 353 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  43.1 
 
 		 269 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  28.95 
 
 		 233 aa  52  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  42.65 
 
 		 263 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  28.95 
 
 		 245 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  34.53 
 
 		 346 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  28.95 
 
 		 233 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  38.37 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  37.89 
 
 		 272 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  36.08 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  36.08 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  40.28 
 
 		 247 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  29.84 
 
 		 263 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  35.63 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  41.77 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  44.19 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  43.14 
 
 		 265 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 281 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 281 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 276 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  42.65 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 278 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 276 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  35.71 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  31.62 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 279 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 290 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  33.64 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  42.25 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 258 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 279 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  37.7 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  39.66 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  39.66 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  36.11 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.55 
 
 		 368 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.55 
 
 		 368 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.55 
 
 		 368 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  45.16 
 
 		 368 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  34.58 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  45.16 
 
 		 368 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1625  molybdate transport repressor  45.16 
 
 		 368 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  33.73 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 278 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  34.52 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  37.65 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  45.16 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  37.5 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0446  molybdate transport repressor  45.16 
 
 		 344 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3008  regulatory protein  45.16 
 
 		 344 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  37.29 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  34.09 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  33.72 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2591  molybdate transport repressor  45.16 
 
 		 359 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  30.21 
 
 		 242 aa  45.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3707  periplasmic-binding protein  47.37 
 
 		 361 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0963  molybdate transport repressor  45.16 
 
 		 359 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2960  LysR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 359 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>