More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3857 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
281 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
281 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
278 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  92.45 
 
 
278 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  87.81 
 
 
279 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  87.81 
 
 
279 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  87.92 
 
 
278 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  77.44 
 
 
282 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  77.74 
 
 
282 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  77.74 
 
 
282 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  77.74 
 
 
282 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  77.74 
 
 
282 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  77.74 
 
 
282 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  77.36 
 
 
282 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  77.57 
 
 
262 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  71.21 
 
 
278 aa  341  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  68.94 
 
 
278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  66.42 
 
 
276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  58.11 
 
 
290 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  57.99 
 
 
268 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  56.18 
 
 
269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  55.97 
 
 
270 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  55.97 
 
 
270 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  45.17 
 
 
270 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  47.58 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  49.06 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  48.12 
 
 
276 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  46.84 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  42.44 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  50.6 
 
 
270 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  47.55 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  46.72 
 
 
281 aa  198  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  47.17 
 
 
263 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  41.22 
 
 
260 aa  195  6e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  47.37 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
262 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  42.24 
 
 
270 aa  188  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  42.01 
 
 
269 aa  185  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  43.02 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  42.75 
 
 
265 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  42.37 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  46.95 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.95 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  40.61 
 
 
270 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  44.18 
 
 
268 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  44.13 
 
 
263 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  40.46 
 
 
269 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  36.82 
 
 
261 aa  166  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
263 aa  166  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  35.23 
 
 
263 aa  165  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  45.27 
 
 
252 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  42.15 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  42.97 
 
 
263 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  41.7 
 
 
263 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  42.15 
 
 
260 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  39.25 
 
 
270 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  44.67 
 
 
252 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  41.3 
 
 
263 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  36.6 
 
 
257 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  40.24 
 
 
270 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
254 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  31.06 
 
 
261 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  44.21 
 
 
254 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  40.64 
 
 
263 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.39 
 
 
254 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  43.44 
 
 
254 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  38.55 
 
 
263 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  42.21 
 
 
254 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  53.52 
 
 
142 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  41.22 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  41.95 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.92 
 
 
263 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  39.3 
 
 
267 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  43.03 
 
 
254 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.52 
 
 
298 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.52 
 
 
263 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  36.88 
 
 
266 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.43 
 
 
263 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  41.13 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.52 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.82 
 
 
263 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  51.77 
 
 
155 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  53.52 
 
 
141 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  44.19 
 
 
254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  37.74 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  54.93 
 
 
141 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  52.11 
 
 
142 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.21 
 
 
263 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  54.23 
 
 
141 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  54.23 
 
 
140 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  53.52 
 
 
141 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  52.82 
 
 
141 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  53.52 
 
 
141 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  53.52 
 
 
141 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.98 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  50.35 
 
 
142 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.71 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  52.82 
 
 
141 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  50.35 
 
 
142 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.82 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>