294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1275 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  100 
 
 		 141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  92.86 
 
 		 140 aa  254  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  76.6 
 
 		 141 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  75.89 
 
 		 141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  76.6 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  76.6 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  75.89 
 
 		 141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  75.89 
 
 		 141 aa  209  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  73.05 
 
 		 141 aa  205  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  78.87 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  68.79 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  62.41 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  61.27 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 278 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  53.15 
 
 		 278 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  54.23 
 
 		 282 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  54.23 
 
 		 282 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  54.23 
 
 		 282 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  54.23 
 
 		 282 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  54.23 
 
 		 282 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  54.23 
 
 		 262 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  54.23 
 
 		 282 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  53.57 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 276 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 278 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  53.52 
 
 		 282 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 276 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  50 
 
 		 269 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 281 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 281 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 278 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 268 aa  124  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  50 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  50.7 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  50.35 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  48.57 
 
 		 268 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  48.55 
 
 		 272 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 290 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  49.64 
 
 		 281 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 278 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  47.14 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 279 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  47.48 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  46.1 
 
 		 270 aa  116  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 279 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  45.71 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  51.77 
 
 		 267 aa  114  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  46.1 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  45 
 
 		 269 aa  114  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  45.39 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  49.29 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  46.43 
 
 		 270 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  46.81 
 
 		 263 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  45.77 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  46.1 
 
 		 263 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  48.55 
 
 		 265 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  48.55 
 
 		 265 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  45.65 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 268 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 274 aa  105  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 269 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  44.53 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  44.2 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 262 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  46.38 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 270 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  45.39 
 
 		 269 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 263 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  43.48 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 269 aa  97.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  43.97 
 
 		 262 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  45.39 
 
 		 270 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  45.32 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  45.39 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  39.57 
 
 		 270 aa  94.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  39.01 
 
 		 378 aa  93.6  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  40 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  40.14 
 
 		 270 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  40.14 
 
 		 270 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  44.37 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  39.01 
 
 		 263 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  39.01 
 
 		 260 aa  90.1  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  38.57 
 
 		 265 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  42.25 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 263 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 261 aa  88.2  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 267 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  39.04 
 
 		 269 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  41.13 
 
 		 452 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  36.23 
 
 		 270 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  36.17 
 
 		 263 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 263 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  40.29 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  38.46 
 
 		 374 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  35.71 
 
 		 359 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  37.76 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>