More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1477 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  100 
 
 
272 aa  557  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  63.77 
 
 
270 aa  348  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  56.93 
 
 
276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  52.81 
 
 
270 aa  291  9e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  44.78 
 
 
270 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  48 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  42.46 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  44.18 
 
 
269 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  48.99 
 
 
290 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  43.51 
 
 
269 aa  188  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  49.06 
 
 
281 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  49.06 
 
 
281 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  49.06 
 
 
278 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  44.66 
 
 
268 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  47.92 
 
 
278 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  46.18 
 
 
281 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  42.57 
 
 
265 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  47.55 
 
 
278 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  46.18 
 
 
269 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  46.99 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  44.27 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  46.21 
 
 
282 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  48.22 
 
 
278 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  42.91 
 
 
267 aa  178  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  46.37 
 
 
276 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  47.83 
 
 
278 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  43.89 
 
 
269 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  45.38 
 
 
270 aa  175  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  46.24 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  44.11 
 
 
263 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  44.49 
 
 
263 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  41.77 
 
 
263 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
262 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  39.85 
 
 
257 aa  169  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  45.99 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  45.99 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  45.99 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  45.99 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  45.99 
 
 
262 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  45.99 
 
 
282 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  45.99 
 
 
282 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  40.3 
 
 
262 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  40.46 
 
 
270 aa  165  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.61 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  41.98 
 
 
270 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  40.96 
 
 
274 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  42.59 
 
 
265 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  41.37 
 
 
260 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42.59 
 
 
265 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  42.52 
 
 
270 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  42.52 
 
 
270 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  40.4 
 
 
263 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  38.25 
 
 
263 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  40.71 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  36.8 
 
 
263 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  33.86 
 
 
263 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  37.75 
 
 
263 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  32.45 
 
 
263 aa  148  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  34.02 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  38.4 
 
 
263 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  37.89 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  34.56 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.74 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.15 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38 
 
 
263 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  38.35 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  33.47 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  42.11 
 
 
254 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  40.16 
 
 
263 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.4 
 
 
262 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.76 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  41.3 
 
 
254 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.43 
 
 
269 aa  132  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  40.49 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  37.9 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  36.26 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  40.89 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.8 
 
 
263 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.75 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  51.45 
 
 
141 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  52.17 
 
 
141 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  52.17 
 
 
141 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2881  transcriptional regulator, ModE family  37.75 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000144972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.75 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2901  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.75 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.052498  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.75 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.75 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0864  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.75 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108345  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  39.27 
 
 
252 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 
141 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  40.08 
 
 
254 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  47.83 
 
 
142 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  49.28 
 
 
141 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
254 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  50 
 
 
141 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  50.36 
 
 
177 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  48.55 
 
 
141 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  40.41 
 
 
254 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  47.1 
 
 
142 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>